Vědecko výzkumná činnost

Struktura Ústavu chemie a biochemie je tvořena pěti výzkumnými skupinami rozdělenými do šestnácti laboratoří zaměřených na klíčové oblasti jako jsou bioanalytická chemie, řasové a rostlinné biotechnologie a v neposlední řadě experimentální mikrobiální a živočišná biochemie a biologie. Výzkumná činnost ústavu je tak rozdělena podle specializací do jednotlivých skupin a laboratoří, které spolu úzce spolupracují.

  • Moderní přístrojové a laboratorní zázemí
  • Propojení chemie, biochemie a aplikovaného výzkumu
  • Výzkum s praktickým dopadem
  • Zapojení studentů do reálného výzkumu
  • Spolupráce napříč pracovišti a se zahraničními partnery
  • Publikační a projektové příležitosti

Výzkumné skupiny

Výzkumná skupina se zaměřuje na vývoj bioanalytických metod pro analýzu biomarkerů pomocí kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie. Dále vyvíjí inovativní přístupy s využitím magnetické separace a elektrochemické či optické detekce pro molekulární a imunodiagnostiku. Cílem je převod metod do funkčních zařízení (TRL 1–6) pro rychlou analýzu v místě potřeby. Aplikace zahrnují humánní, veterinární i environmentální oblasti.

Vedoucí výzkumné skupiny

doc. RNDr. Ondřej Zítka, Ph.D.
Akademický pracovník – docent – Ústav chemie a biochemie
Zástupce vedoucího – Ústav chemie a biochemie
ÚCB AF, Zemědělská 1, 61300 Brno – Budova D
Kancelář: D4.12

Projekty

  • 2023-2026: FW01010052, APLIKACE v oblasti moderních imunodiagnostických
    technologií, spoluřešitel, dotace 15 000 tis. (40 804 tis.) Kč
  • 2023-2027: TN02000017, TAČR Národní Centrum Biotechnologií ve Veterinární Medicíně
    (NACeBiVet). Řešitel dílčího projektu – Vývoj veterinární diagnostické platformy Point-of-
    Need pro detekci patogenů s využitím LAMP technologie, dotace 8 700 tis. (19 800 tis.) Kč
  • 2021-2022: Bezpečnostní výzkum, MVČR (VI04000057), Velmi rychlý přenosný systém
    pro detekci SARS-CoV-2“. Spoluřešitel, dotace 4 700 tis. (14 700 tis.) Kč
  • 2020-2023: TAČR TREND (FW01010052), Vývoj nových laboratorních testů pro
    diagnostiku zánětu, sepse a kardiovaskulárních onemocnění na principu
    chemiluminiscenční analýzy na automatizovaných platformách, spoluřešitel, dotace
    21 800 tis. Kč
  • 2020-2022: TAČR TREND (FW01010202), Výzkum a vývoj inovativních řešení v
    laboratorní diagnostic, spoluřešitel, dotace 14 900 tis. Kč
  • Hasso, M., Kudr, J., Zitka, J., Sileny, J., Svec, P., Svorc, Ľ. & Zitka, O. 2024. Proving the automatic benchtop electrochemical station for the development of dopamine and paracetamol sensors. Microchimica Acta, 191, 1-12 .https://doi.org/10.1007/s00604-024-06454-6
  • Sun, A., Voparilova, P., Liu, X., Kou, B., Reznicek, T., Lednicky, T., Ni, S., Kudr, J., Zitka, O., Fohlerova, Z., Pajer, P., Zhang, H. & Neuzil, P. 2024. An integrated microfluidic platform for nucleic acid testing. Microsystems & Nanoengineering, 10, 1-14. https://doi.org/10.1038/s41378-024-00677-6
  • Peris-Diaz, M. D., Guran, R., Domene, C., De los Rios, V., Zitka, O., Adam, V. & Krezel, A. 2021. An integrated mass spectrometry and molecular dynamics simulations approach reveals the spatial organization impact of metal-binding sites on the stability of metal-depleted metallothionein-2 species. J. Am. Chem. Soc., 143, 16486-16501 .DOI: 10.1021/jacs.1c05495
  • Kudr, J., Michalek, P., Adam, V. & Zitka, O. 2021. COVID-19: A challenge for electrochemical biosensors. TRAC-Trends Anal. Chem., 136, 1-9. https://doi.org/10.1016/j.trac.2021.116192
  • Peris-Diaz, M. D., Guran, R., Zitka, O., Adam, V. & Krezel, A. 2021. Mass spectrometry-based structural analysis of cysteine-rich metal-binding sites in proteins with MetaOdysseus R software. J. Proteome Res., 20, 776-785. https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jproteome.0c00651
  • Vanickova, L., Guran, R., Kollar, S., Emri, G., Krizkova, S., Do, T., Heger, Z., Zitka, O. & Adam, V. 2019. Mass spectrometric imaging of cysteine rich proteins in human skin. Int. J. Biol. Macromol., 125, 270-277. https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2018.11.272
  • Kudr, J., Klejdus, B., Adam, V. & Zitka, O. 2018. Magnetic solids in electrochemical analysis. TRAC-Trends Anal. Chem., 98, 104-113. https://doi.org/10.1016/j.trac.2017.10.023

Výzkumná skupina Molekulární biologie a nanomedicíny je založena na multidisciplinárním propojení chemie, biologie, nanotechnologií a medicíny. Skládá se z pěti specializovaných laboratoří: molekulární biologie, CAM in vivo modelů, výpočetní a strukturní biologie, nanomedicíny a bioortogonální chemie. Zaměřuje se na studium mechanismů nádorových onemocnění, chemoresistence a vývoj cílených terapeutik pro precizní medicínu. Využívá technologie pro rekombinantní proteiny a nanonosiče a provádí testování od buněčných kultur až po in vivo modely.

Vedoucí výzkumné skupiny

doc. Mgr. Zbyněk Heger, Ph.D.
Akademický pracovník – docent – Ústav chemie a biochemie
Vedoucí ústavu – Ústav chemie a biochemie
ÚCB AF, Zemědělská 1, 61300 Brno – Budova D
Kancelář: D4.11

Projekty

  • 2021/2024 – AZV ČR: Feritin jako nástroj pro enzymy-řízenou aktivaci proléčiv
  • 2019/2021 – CAČR, Enkapsulace reaktivátorů cholinesteras pomocí apoferitinu pro zvýšení biodostupnosti v centrálním nervovém systému
  • 2018/2020 – GAČR, Komplexní pohled na mechanismus působení a metabolismus inhibitorů tyrosinkinas a studium přístupů k potenciaci jejich protinádorové účinnosti
  • 2019/2021 – DFG-GAČR, Zinek-dependentní signalizace a exprese sub/isoforem metalothioneinu v karcinomu prsu: implikace pro prognostické a terapeutické účely
  • 2018/2022 – Towards the Understanding a Metal-Tumor Metabolism, ERC Starting Grant, ERC-2017-STG
  • 2014/2015 – Kombinovaná terapie nádorů plic založená na chytrých nanotechnologiích, Liga proti rakovině Praha
  • 2015/2016 – Epidemiologický screening sarkosinu v moči a jeho využití pro včasnou diagnostiku nádorů prostaty, Liga proti rakovině Praha
  • 2016/2017 – Enzymy metabolismu sarkosinu a jejich vliv na proliferaci a agresivitu maligních a benigních prostatických buněk, Liga proti rakovině Praha
  • 2017/2019 – GAČR, Konstrukce modifikovaných apoferitinových nanočástic s protinádorovými léčivy a studium mechanismů potencujících jejich efektivitu v terapii
  • 2016 / 2018 – GAČR, Studium metabolismu sarkosinu a jeho participace na vývoji nádorů prostaty
  • 2015/2019 – AZV, Vliv metalothioneinů na vazbu platinových cytostatik na DNA v nádorových buňkách
  • 2015/2016 – H2020-JTI-IMI2-2014-02-single, Ultra-Fast Molecular Filovirus Diagnostics „FILODIAG“, IMI2-2014-02-05
  • 2014/2016 – GAČR, Vývoj nanočástic obsahujících cytostatika a enzymy pro zlepšení chemoterapie lidských neuroblastomů a studium mechanismu jejich působení
  • HADDAD, H.; REMES, M.; ADAM, V.; HEGER, Z. Toward structure-based drug design against the epidermal growth factor receptor (EGFR). Drug Discov. Today, 2021, vol. 26. p. 289-295. ISSN 1359-6446. IF 7.851
  • ASSERGHINE, A.; ASHRAFI, A.; MUKHERJEE, A.; PETRLAK, F.; HEGER, Z.; SVEC, P.; RICHTERA, L.; NAGY, L.; SOUTO, R. M.; NAGY, G.; ADAM, V. In situ investigation of the cytotoxic and interfacial characteristics of titanium when galvanically coupled with magnesium using scanning electrochemical microscopy. ACS Appl. Mater. Interfaces, 2021, vol. 13. p. 43587-43596. ISSN 1944-8244. IF 9.229
  • HAMEDUH, T.; MOKRY, M.; MILLER, A. D.; ADAM, V.; HEGER, Z.; HADDAD, Y. A rotamer relay information system in the epidermal growth factor receptor–drug complexes reveals clues to new paradigm in protein conformational change. Comp. Struct. Biotechnol. J., 2021, vol. 19. p. 5443-5454. ISSN 2001-0370. IF 7.271
  • HOFMANN, T.; ALBERT, L.; NEMETH, L.; VRSANSKA, M.; SCHLOSSEROVA, N.; VOBERKOVA, S.; VISI-RAJCZI, E. Antioxidant and antibacterial properties of Norway Spruce (Picea abies H. Karst.) and Eastern Hemlock (Tsuga canadensis (L.) Carrière) cone extracts. Forests, 2021, vol. 12. p. 1-23. ISSN 1999-4907. IF 2.633
  • MERLOS, M. A. R.; CASAR, B.; MICHALKOVA, H.; JIMENEZ JIMENEZ, A. M.; HEGER, Z.; ADAM, V. Extending the applicability of In ovo and ex ovo chicken chorioallantoic membrane assays to study cytostatic activity in neuroblastoma cells. Front. Oncol., 2021, vol. 11. p. 1-10. ISSN 2234-943X. IF 6.244
  • RESSNEROVA, A.; NOVOTNY, F.; MICHALKOVA, H.; PUMERA, M.; ADAM, V.; HEGER, Z. Efficient protein transfection by swarms of chemically powered plasmonic virus-sized nanorobots. ACS Nano, 2021, vol. 15. p. 12899-12910. ISSN 1936-0851. IF 15.881
  • HRAZDILOVA, K.; LESICZKA, P. M.; BARDON, J.; VYROUBALOVA, S.; SIMEK, B.; ZUREK, L.; MODRY, D. Wild boar as a potential reservoir of zoonotic tick-borne pathogens. Ticks Tick-Borne Dis., 2021, vol. 12. p. 1-6. ISSN 1877-9603. IF 3.744
  • JAKLOVA, K.; FEGLAROVA, T.; REX, S.; HEGER, Z.; ECKSCHLAGER, T.; HRABETA, J.; HODEK, P.; KOLARIK, M.; INDRA, R. Apoferritin/Vandetanib Association Is Long-Term Stable But Does Not Improve Pharmacological Properties of Vandetanib. Int. J. Mol. Sci., 2021, vol. 22. p. 1-12. ISSN 1422-0067. IF 5.923
  • MASARYK, L.; TESAROVA, B.; CHOQUESILLO-LAZARTE, D.; MILOSAVLJEVIC, V.; HEGER, Z.; KOPEL, P. Structural and biological characterization of anticancer nickel(II) bis(benzimidazole) complex J. Inorg. Biochem., 2021, vol. 217. p. 1-10. ISSN 0162-0134. IF 4.155
  • MERLOS, M. A. R.; MICHALKOVA, H.; STRMISKA, V.; CASAR, B.; CRESPO, P.; DE LOS RIOS, V.; CASAL, J. I.; HADDAD, H.; GURAN, R.; ECKSCHLAGER, T.; POKORNA, P.; HEGER, Z.; ADAM, V. Metallothionein-3 promotes cisplatin chemoresistance remodelling in neuroblastoma. Sci. Rep., 2021, vol. 11. p. 1-14. ISSN 2045-2322. IF 4.379
  • PERIS-DIAZ, M. D.; GURAN, R.; ZITKA, O.; ADAM, V.; KREZEL, A. Mass spectrometry-based structural analysis of cysteine-rich metal-binding sites in proteins with MetaOdysseus R software. J. Proteome Res., 2021, vol. 20. p. 776-785. ISSN 1535-3893. IF 4.466
  • SKUBALOVA, Z.; REX, S.; SUKUPOVA, M.; ZAHALKA, M.; SKLADAL, P.; PRIBYL, J.; MICHALKOVA, H.; WEERASEKERA, A.; ADAM, V.; HEGER, Z. Passive diffusion vs. active pH-dependent encapsulation of tyrosine kinase inhibitors vandetanib and lenvatinib into folate-targeted ferritin delivery system. Int. J. Nanomed., 2021, vol. 16. p. 1-14. ISSN 1178-2013. IF 6.400
  • SMIDOVA, V.; MICHALEK, P.; GOLIASOVA, Z.; ECKSCHLAGER, T.; HODEK, P.; ADAM, V.; HEGER, Z. Nanomedicine of tyrosine kinase inhibitors. Theranostics, 2021, vol. 11. p. 1546-1567. ISSN 1838-7640. IF 11.556
  • STEPANKOVA, H.; SWIATKOWSKI, M.; KRUSZYNSKI, R., .; SVEC, P.; MICHALKOVA, H.; SMOLIKOVA, V.; RIDOSKOVA, A.; SPLICHAL, Z.; MICHALEK, P.; RICHTERA, L.; KOPEL, P.; ADAM, V.; HEGER, Z.; REX, S. The anti-proliferative activity of coordination compound-based ZnO nanoparticles as a promising agent against triple negative breast cancer cells. Int. J. Nanomed., 2021, vol. 2021. p. 4431-4449. ISSN 1178-2013. IF 6.400
  • MUCHOVA, J.; HEARNDEN, V.; MICHLOVSKA, L.; VISTEJNOVA, L.; ZAVADAKOVA, A.; SMERKOVA, K.; KOCIOVA, S.; ADAM, V.; KOPEL, P.; VOJTOVA, L. Mutual influence of selenium nanoparticles and FGF2‑STAB® on biocompatible properties of collagen/chitosan 3D scaffolds: in vitro and ex ovo evaluation. J. Nanobiotechnol., 2021, vol. 19. p. 1-16. ISSN 1477-3155. IF 10.435
  • Tesarova, B.; Dostalova, S.; Smidova, V.; Goliasova, Z.; Skubalova, Z.; Michalkova, H.; Hynek, D.; Michalek, P.; Polanska, H.; Vaculovicova, M.; Hacek, J.; Eckschlager, T.; Stiborova, M.; Pires, A. S.; Neves, A. R. M.; Abrantes, A. M.; Rodrigues, T.; Matafome, P.; Botelho, M. F.; Teixeira, P.; Mendes, F.; Heger, Z.; Surface-PASylation of ferritin to form stealth nanovehicles enhances in vivo therapeutic performance of encapsulated ellipticine. Appl. Mater. Today, 2020, 18, art. no. 100501. DOI: 10.1016/j.apmt.2019.100501.
  • Michalkova, H.; Skubalova, Z.; Sopha, H.; Strmiska, V.; Tesarova, B.; Dostalova, S.; Svec, P.; Hromadko, L.; Motola, M.; Macak, J. M.; Adam, V.; Heger, Z.; Complex cytotoxicity mechanism of bundles formed from self-organised 1-D anodic TiO2 nanotubes layers. J. Hazard. Mater. 2020, 388, art. no. 122054. DOI: 10.1016/j.jhazmat.2020.122054.
  • Moulick, A.; Heger, Z.; Milosavljevic, V.; Richtera, L.; Barroso-Flores, J.; Rodrigo, M. A. M.; Buchtelova, H.; Podgajny, R.; Hynek, D.; Kopel, P.; Adam, V.; Real-time visualization of cell membrane damage using gadolinium-Schiff base complex-doped quantum dots. ACS Appl. Mater. Interfaces, 2018, 10, 35859-35868. DOI: 10.1021/acsami.8b15868.
  • Dostalova, S.; Polanska, H.; Svobodova, M.; Balvan, J.; Krystofova, O.; Haddad, Y.; Krizkova, S.; Masarik, M.; Eckschlager, T.; Stiborova, M.; Heger, Z.; Adam, V.; Prostate-specific membrane antigen-targeted site-directed antibody-conjugated apoferritin nanovehicle favorably influences in vivo side effects of doxorubicin. Sci. Rep. 2018, 8, art. no. 8867. DOI: 10.1038/s41598-018-26772-z.
  • Buchtelova, H.; Strmiska, V.; Skubalova, Z.; Dostalova, S.; Michalek, P.; Krizkova, S.; Hynek, D.; Kalina, L.; Richtera, L.; Moulick, A.; Adam, V.; Heger, Z.; Improving cytocompatibility of CdTe quantum dots by Schiff-base-coordinated lanthanides surface doping. J. Nanobiotechnol. 2018, 16, art. no. 43. DOI: 10.1186/s12951-018-0369-7.
  • Villa, K.; Krejcova, L.; Novotny, F.; Heger, Z.; Sofer, Z.; Pumera M.; Cooperative multifunctional self-propelled paramagnetic microrobots with chemical handles for cell manipulation and drug delivery. Adv. Funct. Mater. 2018, 28, art. no. 1804343. DOI: 10.1002/adfm.201804343.
  • Smidova, V.; Michalek, P.; Goliasova, Z.; Eckschlager, T.; Hodek, P.; Adam, V.; Heger, Z.; Nanomedicine of tyrosine kinase inhibitors. Theranostics, 2021, 11(4), 1546-1567. DOI: 10.7150/thno.48662.
  • Tesarova, B.; Musilek, K.; Rex, S.; Heger, Z.; Taking advantage of cellular uptake of ferritin nanocages for targeted drug delivery. J. Control. Release, 2020, 325, 176-190. DOI: 10.1016/j.jconrel.2020.06.026.
  • Strmiska, V.; Michalek, P.; Lackova, Z.; Guran, R.; Krizkova, S.; Vanickova, L.; Zitka, O.; Stiborova, M.; Eckschlager, T.; Klejdus, B.; Pacik, D.; Tvrdikova, E.; Keil, C.; Haase, H.; Adam, V.; Heger, Z.; Sarcosine is a prostate epigenetic modifier that elicits aberrant methylation patterns through the SAMe-Dnmts axis. Mol. Oncol. 2019, 13, 1002-1017. DOI: 10.1002/1878-0261.12439.
  • Khezri,; Mousavi, S. M. B.; Krej; Heger,; Sofer,; Pumera; Ultrafast Electrochemical Trigger Drug Delivery Mechanism for Nanographene Micromachines. Adv. Funct. Mater. 2019, 29, 1-10. DOI: 10.1002/adfm.201806696.
  • Bytesnikova, Z.; Richtera, L.; Smerkova, K.; Adam, V.; The graphene oxide as a tool for antibiotic resistance genes removal: A review. Environ. Sci. Pollut. Res. 2019, 26, 20148-20163. DOI: 10.1007/s11356-019-05283-y.
  • Skubalova, Z.; Michalkova, H.; Michalek, P.; Strmiska, V.; Guran, R.; Merlos, M. A. R.; Castkova, K.; Hynek, D.; Pekarik, V.; Zitka, O.; Adam, V.; Heger, Z.; Prevalent anatase crystalline phase increases the cytotoxicity of biphasic titanium dioxide nanoparticles in mammalian cells. Colloid Surf. B-Biointerfaces 2019, 182, 1-10. DOI: 1.
  • Strmiska, V.; Michalek, P.; Eckschlager, T.; Stiborova, M.; Adam, V.; Krizkova, S.; Heger, Z.; Prostate cancer-specific hallmarks of amino acids metabolism: Towards a paradigm of precision medicine. Biochim. Biophys. Acta-Rev. Cancer 2019, 1871, 248-258. DOI: 10.1016/j.bbcan.2019.01.001.
  • Haddad, Y.; Adam, V.; Heger, Z.; Rotamer dynamics: analysis of rotamers in molecular dynamics simulations of proteins . Biophys. J. 2019, 116, 2062-2072. DOI: 10.1016/j.bpj.2019.04.017.
  • Vanickova, L.; Guran, R.; Kollar, S.; Emri, G.; Krizkova, S.; Do, T.; Heger, Z.; Zitka, O.; Adam, V.; Mass spectrometric imaging of cysteine rich proteins in human skin. Int. J. Biol. Macromol. 2019, 125, 270-277. DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2018.11.272.
  • Tesarova, B.; Charousova, M.; Dostalova, S.; Bienko, A.; Kopel, P.; Kruszynski, R.; Hynek, D.; Michalek, P.; Eckschlager, T.; Stiborova, M.; Adam, V.; Heger, Z.; Folic acid-mediated re-shuttling of ferritin receptor specificity towards a selective delivery of highly cytotoxic nickel(II) coordination compounds. Int. J. Biol. Macromol. 2019, 126, 1099-1111. DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2018.12.128.
  • Peskova, M.; Ilkovics, L.; Hynek, D.; Dostalova, S.; Sanchez-Carnerero; Remes, M.; Heger, Z.; Pekarik, V.; Detergent-modified catalytic and enzymomimetic activity of silver and palladium nanoparticles biotemplated by Pyrococcus furiosus ferritin. J. Colloid Interface Sci. 2019, 537, 20-27. DOI: 10.1016/j.jcis.2018.11.005.
  • Jelinkova, P.; Mazumdar, A.; Sur, V. P.; Kociova, S.; Dolezelikova, K.; Jimenez Jimenez, A. M.; Koudelkova, Z.; Mishra, P. K.; Smerkova, K.; Heger, Z.; Vaculovicova, M.; Moulick, A.; Adam, V.; Nanoparticle-drug conjugates treating bacterial infections. J. Control. Release 2019, 307, 166-185. DOI: 10.1016/j.jconrel.2019.06.013.
  • Buchtelova, H.; Skubalova, Z.; Strmiska, V.; Michalek, P.; Kociova, S.; Smerkova, K.; Kruszynski,; Bienko,; Kaj,; Lewinska,; Bienko,; Malik-Gajewska,; Milosavljevic,; Kopel,; Heger,; Adam, V.; Synthesis and structural characterization of antimicrobial binuclear copper (II) coordination compounds bridged by hydroxy- and/or thiodipropionic acid. J. Inorg. Biochem. 2019, 191, 8-20. DOI: 10.1016/j.jinorgbio.2018.10.011.
  • Ananbeh, H. A. A. A.; Stojanovic, M.; Pompeiano, A.; Voberkova, S.; Trasar-Cepeda, C.; Use of soil enzyme activities to assess the recovery of soil functions in abandoned coppice forest systems. Sci. Total Environ. 2019, 694, art. no. 133692. DOI: https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2019.133692.
  • Jimenez Jimenez, A. M.; Moulick, A.; Bhowmick, S.; Strmiska, V.; Gagic, M.; Horakova, Z.; Kostrica, R.; Masarik, M.; Heger, Z.; Adam, V.; One-step detection of human papilloma viral infection using quantum dot-nucleotide interaction specificity. Talanta 2019, 205, 1-8. DOI: 10.1016/j.talanta.2019.07.006.
  • Indra, R.; Cerna, T.; Heger, Z.; Hrabeta, J.; Wilhelm, M.; Dostalova, S.; Lengalova, A.; Martinkova, M.; Adam, V.; Eckschlager, T.; Schmeiser, H. H.; Arlt, V. M.; Stiborova, M.; Ellipticine-loaded apoferritin nanocarrier retains DNA adduct-based cytochrome P450-facilitated toxicity in neuroblastoma cells. Toxicology 2019, 419, 40-54. DOI: 10.1016/j.tox.2019.03.009.
  • Milosavljevic, V.; Jamroz, E.; Gagic, M.; Haddad, Y.; Michalkova, H.; Balkova, R.; Tesarova, B.; Moulick, A.; Heger, Z.; Richtera, L.; Kopel, P.; Adam, V.; Encapsulation of Doxorubicin in Furcellaran/Chitosan Nanocapsules by Layer-by-Layer Technique for Selectively Controlled Drug Delivery. Biomacromolecules 2019, in press, . DOI: 10.1021/acs.biomac.9b01175 .
  • Gagic, M.; Jamroz, E.; Krizkova, S.; Milosavljevic, V.; Kopel, P.; Adam, V.; Current trends in detection of histamine in food and beverages . J. Agric. Food Chem. 2019, 67, 773-783. DOI: 10.1021/acs.jafc.8b05515.
  • Merlos, M. A. R.; Buchtelova, H.; de los Rios; Casal; Eckschlager, T.; Hrabeta, J.; Belhajova, M.; Heger, Z.; Adam, V.; Proteomic signature of neuroblastoma cells UKF-NB-4 reveals key role of lysosomal sequestration and the proteasome complex in acquiring chemoresistance to cisplatin. J. Proteome Res. 2019, 18, 1255-1263. DOI: 10.1021/acs.jproteome.8b00867 .
  • Beladi-Mousavi,; Khezri,; Krej; Heger,; Sofer,; Fisher,; Pumera; Recoverable Bismuth-Based Microrobots: Capture, Transport, and On-Demand Release of Heavy Metals and an Anticancer Drug in Confined Spaces . ACS Appl. Mater. Interfaces 2019, 11, 13359-13369. DOI: 10.1021/acsami.8b19408.
  • Horky, P.; Skalickova, S.; Urbankova, L.; Baholet, D.; Kociova, S.; Bytesnikova, Z.; Kabourkova, E.; Lackova, Z.; Cernei, N.; Gagic, M.; Milosavljevic, V.; Smolikova, V.; Vaclavkova, E.; Nevrkla, P.; Knot, P.; Krystofova, O.; Hynek, D.; Kopel, P.; Skladanka, J.; Adam, V.; Smerkova, K.; Zinc phosphate-based nanoparticles as a novel antibacterial agent: in vivo study on rats after dietary exposure. J. Anim. Sci. Biotechnol. 2019, 10, 1-12. DOI: 10.1186/s40104-019-0319-8.
  • Michalkova, H.; Strmiska, V.; Kudr, J.; Skubalova, Z.; Tesarova, B.; Svec, P.; Richtera, L.; Zitka, O.; Adam, V.; Heger, Z.; Tuning the surface coating of IONs towards efficient sonochemical tethering and sustained liberation of topoisomerase II poisons. Int. J. Nanomed. 2019, 14, 7609. DOI: 10.2147/IJN.S208810.

Výzkumná skupina pokročilých biotechnologií a environmentální analýzy (aBETA) propojuje biotechnologie, environmentální vědy, molekulární biologii a analytickou chemii s cílem vyvíjet udržitelná řešení pro současné i budoucí výzvy. Zaměřuje se na aplikace v ochraně životního prostředí, zemědělství, potravinářství a medicíně. Funguje na bázi interdisciplinární spolupráce mezi laboratořemi a klade důraz na sdílení know-how, infrastruktury i zapojení studentů do výzkumu a inovací. Využívá biotechnologie, mikrořasy, rostliny, pokročilé analytické a fotochemické přístupy.

Vedoucí výzkumné skupiny

Ing. Lukáš Nejdl, Ph.D.
Akademický pracovník – odborný asistent – Ústav chemie a biochemie
ÚCB AF, Zemědělská 1, 61300 Brno – Budova D
Kancelář: D4.18

Projekty

  • ESA Spark Funding (ICARUS ARMOR NEXT GEN): Innovative Cognitive And Resilience Understanding System, Team Member (2025–2027)
  • OP PIK: Vývoj unikátních, vzácných bioaktivních komplexů tvořených jednobuněčnými mikroorganismy a přírodními extrakty z vybraných synergických bylin získaných novou inovativní metodou subkritické extrakce (ve spolupráci s UNION COSMETIC) – Team member (2022–2023).
  • H2020 GREENER: InteGRated systems for Effective EnvironmEntal Remediation, Grant Agreement No. 826312 – Team member (2019–2023).
  • Hungry Eco Cities: Naše skupina se do projektu zapojuje svou odborností v oblasti rostlinných věd a molekulární biologie. Podílí se na vedení umělců a inovátorů při navrhování experimentů a dbá na jejich vědeckou kvalitu. Grant Agreement No. 101135691 – Team memer (2023–2025).
  • GREEN DEAL NPO – NPO_MENDELU_MSMT-2126/2024-4: Podpora zelených dovedností a udržitelnosti MENDELU, (2024 – 2025)
  • GAČR – Technika difúzního gradientu v tenkém filmu: účinný nástroj pro předpovídání biologické dostupnosti rtuti 19-11528S (2019-2021)
  • Nejdl, L., Havlikova, M., Mravec, F., Vaculovic, T., Faltusova, V., Pavelicova, K., … & Vaculovicova, M. (2022). UV-Induced fingerprint spectroscopy. Food Chemistry, 368, 130499. https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2021.130499
  • Changela, H.G.; Kebukawa, Y.; Petera, L.; Ferus M.; Chatzitheodoridis, E.; Nejdl, L.; Nebel, R. … & Zapotok,D. The evolution of organic material on Asteroid 162173 Ryugu and its delivery to Earth. Nat Commun 15, 6165 (2024). https://doi.org/10.1038/s41467-024-50004-w
  • Peng, X., Urso, M., Kolackova, M., Huska, D., Pumera, M., Urbis, P., Richtera, L., Pelcova, P. & Adam, V. & (2023). Biohybrid Magnetically Driven Microrobots for Sustainable Removal of Micro/Nanoplastics from the Aquatic Environment. Advanced Functional Materials, 34(3), 1670-1677. https://doi.org/10.1002/adfm.202307477
  • Kolackova, M., Janova, A., Dobesova, M., Zvalova, M., Chaloupsky, P., Krystofova, O., Huska, D., & Adam, V. (2023). Role of secondary metabolites in distressed microalgae. Environmental Research, 224(3), 115392. https://doi.org/10.1016/j.envres.2023.115392
  • Pencik, O., Durdakova, M., Molnarova, K., Kucsera, A., Klofac, D., Kolackova, M., Adam, V., & Huska, D. (2023). Microplastics and nanoplastics toxicity assays: A revision towards to environmental-relevance in water environment. Journal of Hazardous Materials, 454, 131476. https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2023.131476
  • Durdakova, M., Kolackova, M., Ridoskova, A., Cernei, N., Pavelicova, K., Urbis, P., Richtera, L., Pelcova, P., Adam, V., & Huska, D. (2024). Exploring the potential nutritional benefits of Arthrospira maxima and Chlorella vulgaris: A focus on vitamin B12, amino acids, and micronutrients. Food Chemistry, 452, 139434. https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2024.139434
  • Schrey, S. D., Martinez Diaz, J., Becker, L., Mademann, J. A., Ohrem, B., Drobietz, D., Chaloupsky, P., Jablonowski, N. D., Wever, C., Grande, P. M., Pestsova, E., & Klose, H. (2023). Cell wall composition and biomass saccharification potential of Sida hermaphrodita differ between genetically distant accessions. Frontiers in Plant Science, 14. https://doi.org/10.3389/fpls.2023.1191249
  • RIDOŠKOVÁ, Andrea; PELFRÊNE, Aurélie; PELCOVÁ, Pavlína; WATERLOT, Christophe; HOLASOVÁ, Denisa; MORÁVEK, Michal; 2025. Enhancing the prediction of arsenic bioavailability in soils with the diffusive gradient in thin film technique. Chemosphere. 371, 144015. ISSN 0045-6535. https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2024.144015
  • PELCOVÁ, Pavlína; KOPP, Radovan; RIDOŠKOVÁ, Andrea; GRMELA, Jan; ŠTĚRBOVÁ, Dagmar; 2022. Evaluation of mercury bioavailability and phytoaccumulation by means of a DGT technique and of submerged aquatic plants in an aquatic ecosystem situated in the vicinity of a cinnabar mine. Chemosphere. 288, 132545. ISSN 0045-6535. https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2021.132545
  • PELCOVÁ, Pavlína; RIDOŠKOVÁ, Andrea; HRACHOVINOVÁ, Jana; GRMELA, Jan; 2021. Evaluation of mercury bioavailability to vegetables in the vicinity of cinnabar mine. Environmental Pollution. 283, 117092. ISSN 0269-7491. https://doi.org/10.1016/j.envpol.2021.117092

Výzkumná skupina se zaměřuje na syntézu a charakterizaci nanomateriálů a na elektrochemickou analýzu. Připravuje uhlíkaté materiály (např. oxid grafenu) i nanokompozity a studuje jejich využití v zemědělství a biosenzorech. Vyvíjí biosenzory, elektrody a využívá skenovací elektrochemickou mikroskopii pro analýzu materiálů i buněk, včetně detekce hormonů, sacharidů, organických kyselin a aminokyselin. Dále se zabývá produkcí a imobilizací enzymů a testováním jejich aplikací při čištění kontaminovaných vod.

Vedoucí výzkumné skupiny

doc. RNDr. Lukáš Richtera, Ph.D.
Akademický pracovník – docent – Ústav chemie a biochemie
Zástupce vedoucího – Ústav chemie a biochemie
ÚCB AF, Zemědělská 1, 61300 Brno – Budova D
Kancelář: D4.13

Projekty

  • TAČR Gama:  Technologie přípravy antimikrobiálních grafenových nanoformulací pro polymerní kompozitní filamenty pro 3D tisk (2021, Bytešníková)
  • IGA projekt: Elektrochemický biosensor pro monitorování estrogenů ve vodních systémech (2023, Birgusová)
  • IGA projekt:Molekulárně imprintované částice pro analýzu estrogenních polutantů (2024, Birgusová)
  • TAČR TREND (FW01010202): Výzkum a vývoj inovativních řešení v laboratorní diagnostice (2020-2022, Richtera)
  • Kudr, Jiří; Haddad, Yazan; Richtera, Lukáš; Heger, Zbyněk; Černák, Mirko; Adam, Vojtěch; Zítka, Ondřej. Magnetic Nanoparticles: From Design and Synthesis to Real World Applications. Nanomaterials (Basel), 2017, Vol. 7, Issue 9, pp 243. DOI: 10.3390/nano7090243.
  • Skaličková, Sylvie; Milosavljević, Vedran; Číhalová, Kristýna; Horký, Pavel; Richtera, Lukáš; Adam, Vojtěch. Perspective of selenium nanoparticles as a nutrition supplement. Nutrition, 2017, Vol. 33, pp 83–90. DOI: 10.1016/j.nut.2016.05.001.
  • Kudr, Jiří; Richtera, Lukáš; Xhaxhiu, Kledi; Hynek, David; Heger, Zbyněk; Zítka, Ondřej; Adam, Vojtěch. Carbon dots based FRET for the detection of DNA damage. Biosensors and Bioelectronics, 2017, Vol. 92, pp 133–139. DOI: 10.1016/j.bios.2017.01.067.
  • Ashrafi, Amir M.; Bytešníková, Zuzana; Barek, Jiří; Richtera, Lukáš; Adam, Vojtěch. A critical comparison of natural enzymes and nanozymes in biosensing and bioassays. Biosensors and Bioelectronics, 2021, Vol. 192, 113494. DOI: 10.1016/j.bios.2021.113494.
  • Vaňová, Veronika; Mitrevska, Katerina; Milosavljević, Vedran; Hynek, David; Richtera, Lukáš; Adam, Vojtěch. Peptide-based electrochemical biosensors utilized for protein detection. Biosensors and Bioelectronics, 2021, Vol. 180, 113087. DOI: 10.1016/j.bios.2021.113087.
  • Durovic, A.; Stojanovic, Z.; Kravic, S.; Kos, J.; Richtera, L.; Electrochemical Determination of Vitamin D3 in Pharmaceutical Products by Using Boron Doped Diamond Electrode . Electroanalysis 2019, in press, . DOI: 10.1002/elan.201900532 .
  • Bytesnikova, Z.; Richtera, L.; Smerkova, K.; Adam, V.; The graphene oxide as a tool for antibiotic resistance genes removal: A review. Environ. Sci. Pollut. Res. 2019, 26, 20148-20163. DOI: 10.1007/s11356-019-05283-y.

Výzkumná skupina mikrobiologie propojuje základní a aplikovaný výzkum v oblasti veterinární, klinické a environmentální mikrobiologie. Naše práce pokrývá široké spektrum témat od identifikace a charakterizace mikroorganismů po vývoj inovativních antimikrobiálních látek a zkoumání antibiotické rezistence. Využíváme kombinaci klasických kultivačních metod a pokročilých molekulárních přístupů, včetně multi-omických technologií, genomiky, metagenomiky, metabolomiky a syntetické biologie.

Vedoucí výzkumné skupiny

doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D.
Akademický pracovník – docent – Ústav chemie a biochemie
ÚCB AF, Zemědělská 1, 61300 Brno – Budova D
Kancelář: D4.13

Projekty

  • GAČR: Studium diverzity ribozomálně syntetizovaných přírodních látek produkovaných antarktickými extremofily (GA25-17343S), 2024-2027
  • Mendelu, GA GJM A: Dynamika mikrobiomu mléčné žlázy skotu před nástupem a v průběhu mastitidy a vývoj nových typů antibakteriálních látek pro její léčbu, 2024-2027
  • Mendelu, IGA IP 2025: Inovativní antibakteriální nanočástice zaměřené proti biofilmu pro boj s multirezistentními stafylokokovými infekcemi způsobujícími bovinní mastitidu (IGA25-AF-IP-021), 2025
  • Mendelu Igráček (GA25-17343S (2024-2027): Multi-omics approach to study effects of agriculturally-used zinc on Escherichia coli: Risks assessment of bacterial resistance evolution, 2021-2022
  • Izquierdo-Rodriguez, E., Hrazdilová, K., Anettová, L., Šipková, A., Coufal, R., Modrý, D., & Foronda, P. (2024). Co-introduction into a delicate island ecosystem: metastrongyloid nematodes (superfamily Metastrongyloidea) of veterinary and medical importance circulating in aquatic and terrestrial environments of Tenerife (Canary Islands). Parasitology Research, 123, Article 344. https://doi.org/10.1007/s00436-024-08364-1
  • Kosaristanova, L., Bytesnikova, Z., Fialova, T., Pekarkova, J., Svec, P., Ondreas, F., Jemelikova, V., Ridoskova, A., Makovicky, P., Sivak, L., Dolejska, M., Zouharova, M., Slama, P., Adam, V., & Smerkova, K. (2024). In vivo evaluation of selenium-tellurium based nanoparticles as a novel treatment for bovine mastitis. Journal of Animal Science and Biotechnology, 15(1), 17. https://doi.org/10.1186/s40104-024-01128-y
  • Rihacek, M., Kuthanova, M., Splichal, Z., Adam, V., Hrazdilova, K., Vesely, R., Zurek, L., & Cihalova, K. (2023). Escherichia coli from human wounds: Analysis of resistance to β-lactams and expression of RND efflux pumps. Infection and Drug Resistance, 16, 7365–7375. https://doi.org/10.2147/IDR.S435622
  • Lesiczka, P.M., Hrazdilová, K., Hönig, V., Modrý, D., & Zurek, L. (2023). Distant genetic variants of Anaplasma phagocytophilum from Ixodes ricinus attached to people. Parasites & Vectors, 16, Article 80. https://doi.org/10.1186/s13071-023-05654-y
  • Kralova, S., Davidova-Gerzova, L., Valcek, A., Bezdicek, M., Rychlik, I., Rezacova, V., Cizek, A. (2022). Paraphocaeicola brunensis gen. nov., sp. nov., carrying two variants of nimB resistance gene from Bacteroides fragilis, and Caecibacteroides pullorum gen. nov., sp. nov., two novel genera isolated from chicken caeca. Microbiology Spectrum. https://doi.org/1128/spectrum.01954-21
  • Kralova, S.¥, LaFrentz, B.R.¥, Burbick, C.R., Alexander, T.L., Phillips, C.W., Griffin, M.J, Waldbieser, G.C., García, J.C., de Alexandre Sebastião, F., Soto, E., Loch, T.P., Liles, M.R., Snekvik, K.R. (2021) The fish pathogen Flavobacterium columnare represents four distinct species: Flavobacterium columnare, Flavobacterium covae sp. nov., Flavobacterium davisii sp. nov. and Flavobacterium oreochromis sp. nov., and emended description of Flavobacterium columnare. Systematic and Applied Microbiology. ¥authors contributed equally to this work. https://doi.org/1016/j.syapm.2021.126293
  • Rihacek, M., Kosaristanova, L., Fialova, T., Rypar, T., Sterbova, D.S., Adam, V., Zurek, L., Cihalova, K. (2024). Metabolic adaptations of Escherichia coli to extended zinc exposure: insights into tricarboxylic acid cycle and trehalose synthesis. Bmc Microbiology;24(1); doi: 10.1186/s12866-024-03463-6.
  • Rihacek, M., Kosaristanova L., Fialova T., Kuthanova M., Eichmeier A., Hakalova E., Cerny M., Berka M., Palkovicova J., Dolejska M., Svec P., Adam V., Zurek L., Cihalova K. (2023). Zinc effects on bacteria: insights from Escherichia coli by multi-omics approach. mSystems 0(0): e00733-00723. https://doi.org/10.1128/msystems.00733-23
  • Younis, A.B., Milosavljevic, V., Fialova, T., Smerkova, K., Michalkova, H., Svec, P., Antal, P., Kopel, P., Adam, V., Zurek, L., Dolezelikova, K. (2023). Synthesis and characterization of TiO2 nanoparticles combined with geraniol and their synergistic antibacterial activity. Bmc Microbiology 23(1). https://doi.org/10.1186/s12866-023-02955-1
  • Palkovicova, J., Sukkar, I., Delafuente, J., Valcek, A., Medvecky, M., Jamborova, I., Bitar, I., Phan, M.D., San Millan, A., Dolejska, M. Fitness effects of blaCTX-M-15-harbouring F2:A1:B- plasmids on their native Escherichia coli ST131 H30Rx hosts. (2022) Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 77(11):2960-2963. https://doi.org/10.1093/jac/dkac250

Výzkumný tým iNANO se zabývá inteligentním nanoinženýrstvím, tedy návrhem a syntézou pokročilých nanosystémů z atomů, molekul a nanomateriálů. Tyto „nano-LEGO“ systémy integrují různé funkční komponenty, jako jsou senzory, pohybové prvky či reakce na podněty, do jednoho inteligentního celku. Cílem je vývoj samostatně fungujících chytrých materiálů pro využití v nanomedicíně, energetice a ochraně životního prostředí.

Vedoucí výzkumné skupiny

Xiaohui Ju, Ph.D.
Výzkumný pracovník II – Ústav chemie a biochemie
ÚCB AF, Zemědělská 1, 61300 Brno – Budova D
Kancelář: D4.22

Projekty

  • GAČR Standard (PI): Robustní zachytávání reaktivního kyslíku pro antioxidační terapii v nanomedicíně; 2025-2027
  • MŠMT Barrande Mobility Program (PI): Nanočástice oxidu ceru dekorované atomy platiny jako nanozymy regulující oxidační stres, 2023-2024
  • Marie Skłodowska-Curie Actions Fellowship: Vylepšený aktivátor plazminogenu založený na nanočásticích oxidu ceru pro trombolýzu při ischemické mrtvici, 2023
  • GAČR Junior (PI): Interakce hydrofilního polymeru s nanostrukturovaným oxidem ceru pro biomedicínské aplikace, 2019-2021
  • Xiaohui Ju et al., Technology Roadmap of Micro/Nanorobots, ACS Nano, 2025, https://doi.org/10.1021/acsnano.5c0391 , IF 16.0, Journal Cover Art
  • Xiaoui Ju, Eliska Javorkova, , Jan Michalicka, Martin Pumera, Single-atom Colloidal Nanorobotics Enhanced Stem Cell Therapy for Corneal Injury Repair, ACS Nano, 2025, https://doi.org/10.1021/acsnano.4c18874 , IF 16.0, Journal Cover Art
  • Roshan Velluvankandy, Xiaohui Ju, Martin Pumera, Nanorobot-Cell Communication via In Situ Generation of Biochemical Signals: Toward Regenerative Therapies, ACS Nano, 2025, https://doi.org/10.1021/acsnano.5c02092 , IF 16.0, Journal Cover Art
  • Mario Urso, Xiaohui Ju, Radhika Nittoor-Veedu, Hyesung Lee, Dagmar Zaoralová, Michal Otyepka, Martin Pumera, Single Atom Engineering for Electrocatalysis: Fundamentals and Applications, ACS Catalysis, 2025, https://doi.org/10.1021/acscatal.4c08027 , IF 13.1, Journal Cover Art
  • Radhika Nittoor‐Veedu, Xiaohui Ju, Michal Langer, Wanli Gao, Michal Otyepka, Martin Pumera, Periodic Table Exploration of MXenes for Efficient Electrochemical Nitrate Reduction to Ammonia, Small, 2025, IF 12.1
  • Radhika Nittoor-Veedu, Xiaohui Ju, Martin Pumera, Iron Single Atom Catalysts for Electrochemical Ammonia Synthesis: Toward Carbon Free Hydrogen Storage, Advanced Energy Materials, 2024, https://doi.org/10.1002/aenm.202402205 , IF 26.0
  • Xiaohui Ju, Martin Pumera, Single Atom Engineering for Nanorobotics, ACS Nano, 2024, https://doi.org/10.1021/acsnano.4c06880 , IF 16.0
  •  Anna Jancik-Prochazkova, Hanna Kmentova, Xiaohui Ju, Stepan Kment, Radek Zboril, Martin Pumera, Precision Engineering of Nanorobots: Toward Single Atom Decoration and Defect Control for Enhanced Microplastic Capture, Advanced Functional Materials, 2024, https://doi.org/10.1002/adfm.202402567 , IF 19.0
  • Giusy Finocchiaro, Xiaohui Ju, Braham Mezghrani, Jean-François Berret, Cerium Oxide Catalyzed Disproportionation of Hydrogen Peroxide: A Closer Look at The Reaction Intermediate, Chemistry-A European Journal, 2024, https://doi.org/10.1002/chem.202304012 , IF 3.7 2023
  • Ameni Dhouib, Braham Mezghrani, Giusy Finocchiaro, Rémi Le Borgne, Mathéo Berthet, Bénédicte Daydé-Cazals, Alain Graillot, Xiaohui Ju, Jean-François Berret, Synthesis of Stable Cerium Oxide Nanoparticles Coated with Phosphonic Acid-Based Functional Polymers, Langmuir, 2023, https://doi.org/10.1021/acs.langmuir.3c00576 , IF 3.9 2022
  • Olha Purikova, Ihor Tkachenko, Břetislav Šmíd, Kateřina Veltruská, Thu Ngan Dinhová, Maryna Vorokhta, Vladimír Kopecký Jr., Lenka Hanyková, Xiaohui Ju, Free-Blockage Mesoporous Silica Nanoparticles Loaded with Cerium Oxide as ROS-Responsive and ROS-Scavenging Nanomedicine, Advanced Functional Materials, 2022, https://doi.org/10.1002/adfm.202208316 , IF 19.0, Journal Cover Art

Výzkumná skupina Space Agri Technologies (SAT) se zabývá vývojem technologií pro pěstování rostlin, mikrořas, řas a sinic v extrémních podmínkách, včetně kosmického prostoru. Zaměřuje se na tři hlavní směry: stresovou biologii organismů v extrémním prostředí, vývoj a aplikaci biofólií na bázi sacharidů a návrh biologických experimentů pro kosmické mise i simulované expedice. Součástí výzkumu je také inteligentní zemědělství využívající AI a pokročilé systémy.

Vedoucí výzkumné skupiny

Ing. Vedran Milosavljević, Ph.D.
Akademický pracovník – odborný asistent – Ústav chemie a biochemie
ÚCB AF, Zemědělská 1, 61300 Brno – Budova D
Kancelář: D4.24

Projekty

  • TAČR Nováčci: Vývoj znalostní databáze digitálního dvojčete plodin pro efektivní učení umělé inteligence PID: FW09020097 (Žadatel: FRAVEBOT s.r.o.) (2023-2025)
  • Přeshraniční spolupráce CZ-AT: FURPLAST – FURCELLARAN AN INNOVATIVE BIOPOLYMER FOR THE PRODUCTION OF PLASTIC FOILS ON A BIOLOGICAL BASIS (ATCZ00042) (Partners: Wood K Plus, Agrana, Myco).(2025-2027)
  • TAČR Sigma: Biologicky odbouratelné bioplasty: Inovativní vlhkost fixující bio-fólie pro podporu růstu sazenic v aridních podmínkách (partner: Josef Sklenář – Farma Ráječek) (2025-2026)
  • MAiO – v rámci projektu IOSLAB (In-Orbit Servicing LABoratory) společnosti SAB Aerospace s.r.o.. MAiO experiment (Micro Algae in Orbit).
  • ESA Fly Your Satellite – Mise CIMER: Experiement MIBICO. Yspace VUT Brno.
  • H2020: Galileo Enhanced Solution for Pest Detection and Control in Greenhouse Fields with Autonomous Service Robots (776324-GREENPATROL). 2017-2020.
  • Obregón, D., Arnau, R., Campo-Cossio, M., Arroyo-Parras, J.G., Pattinson, M., Tiwari, S., Lluvia, I., Rey, O., Verschoore, J., Lenza, L., & Reyes, J. (2019). Precise Positioning and Heading for Autonomous Scouting Robots in a Harsh Environment. IWINAC 2019. Lecture Notes in Computer Science, vol 11487. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-030-19651-6_9
  • Gutierrez, A., Ansuategi, A., Susperregi, L., Tubío, C., Rankić, I., & Lenža, L. (2019). A benchmarking of learning strategies for pest detection and identification on tomato plants for autonomous scouting robots using internal databases. Journal of Sensors, 2019(1), https://doi.org/10.1155/2019/5219471
  • Pattinson, M., Tiwari, S., Zheng, Y., Fryganiotis, D., Campo-Cossio, M., Arnau, R., … & Gonzalez, J. R. (2020, November). Galileo enhanced solution for pest detection and control in greenhouses with autonomous service robots. In 2020 European Navigation Conference (ENC) (pp. 1-10). IEEE. https://doi.org/10.23919/ENC48637.2020.9317451
  • Milosavljevic, Vedran, Ludmila Kosaristanova, Kristyna Dolezelikova, Vojtech Adam, and Martin Pumera. „Microrobots with Antimicrobial Peptide Nanoarchitectonics for the Eradication of Antibiotic‐Resistant Biofilms.“ Advanced Functional Materials 32, no. 43 (2022): 2112935.   https://doi.org/10.1002/adfm.202112935
  • Kulawik, Piotr, Ewelina Jamróz, Magdalena Janik, Joanna Tkaczewska, Paweł Krzyściak, Magdalena Skóra, Paulina Guzik, Vedran Milosavljević, and Wondyfraw Tadele. „Biological activity of biopolymer edible furcellaran-chitosan coatings enhanced with bioactive peptides.“ Food Control 137 (2022): 108933. https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2022.108933
  • Kulawik, Piotr, Ewelina Jamróz, Magdalena Janik, Joanna Tkaczewska, Paweł Krzyściak, Magdalena Skóra, Paulina Guzik, Vedran Milosavljević, and Wondyfraw Tadele. „Antimicrobial and antioxidant properties of chitosan-furcellaran-gelatin hydrolysate coatings enhanced with bioactive peptides.“ Food Control 153 (2023): 109931. https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2023.109931
  • Kulawik, P., Jamróz, E., Kruk, T., Szymkowiak, A., Tkaczewska, J., Krzyściak, P., Skóra, M., Guzik, P., Janik, M., Vlčko, T. and Milosavljević, V., 2023. Active edible multi-layer chitosan/furcellaran micro/nanoemulsions with plant essential oils and antimicrobial peptides: Biological properties and consumer acceptance. Food Control, 150, p.109767. https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2023.109767
  • Kulawik, Piotr, Ewelina Jamróz, Joanna Tkaczewska, Tomáš Vlčko, Marzena Zając, Paulina Guzik, Magdalena Janik, Wondyfraw Tadele, Jozef Golian, and Vedran Milosavljević. „Application of antimicrobial chitosan-furcellaran-hydrolysate gelatin edible coatings enriched with bioactive peptides in shelf-life extension of pork loin stored at 4 and− 20° C.“ International Journal of Biological Macromolecules 254 (2024): 127865. https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2023.127865
  • Tadele, W., Kulawik, P., Stępień, A., Zając, M., Nowak, N., Grzebieniarz, W., Jasińska, J.M., Vlcko, T., Szymkowiak, A., Milosavljević, V. and Debnarova, D., 2024. Effects of multilayer Nano/Mini Furcellaran/Chitosan Emulsions with oregano essential oil and bioactive peptides on sensory, physicochemical properties and retrogradation in Sushi in cold storage conditions. Innovative Food Science & Emerging Technologies, 96, p.103767. https://doi.org/10.1016/j.ifset.2024.103767
  • Pluta-Kubica, Agnieszka, Ewelina Jamróz, Paulina Guzik, Magdalena Janik, Vedran Milosavljevic, Agnieszka Cholewa-Wójcik, and Piotr Kulawik. „The Effect of Chitosan-Furcellaran Biopolymeric Films and Coatings Incorporated with LL-37 and RW4 Bioactive Peptides on the Microbiological and Sensory Quality of Cheese.“ International Dairy Journal (2024): 106000. https://doi.org/10.1016/j.idairyj.2024.106000
  • Vanova, Veronika, Katerina Mitrevska, Vedran Milosavljevic, David Hynek, Lukas Richtera, and Vojtech Adam. „Peptide-based electrochemical biosensors utilized for protein detection.“ Biosensors and Bioelectronics 180 (2021): 113087. https://doi.org/10.1016/j.bios.2021.113087
  • Jamróz, Ewelina, Pavel Kopel, Lesław Juszczak, Agnieszka Kawecka, Zuzana Bytesnikova, Vedran Milosavljević, Mateusz Kucharek, Małgorzata Makarewicz, and Vojtech Adam. „Development and characterisation of furcellaran-gelatin films containing SeNPs and AgNPs that have antimicrobial activity.“ Food Hydrocolloids 83 (2018): 9-16. https://doi.org/10.1016/j.foodhyd.2018.04.028
  • Jamróz, E., P. Kopel, L. Juszczak, E. Jamroz, P. Kopel, L. Juszczak, A. Kawecka, Z. Býtešníková, V. Milosavljević, and M. Makarewicz. Development of furcellaran-gelatin films with Se-AgNPs as an active packaging system for extension of mini kiwi shelf life. Food Packag Shelf Life 21: 1–9. 2019. https://doi.org/10.1016/j.fpsl.2019.100339
  • Gagic, Milica, Silvia Kociova, Kristyna Smerkova, Hana Michalkova, Milena Setka, Pavel Svec, Jan Pribyl et al. „One-pot synthesis of natural amine-modified biocompatible carbon quantum dots with antibacterial activity.“ Journal of Colloid and Interface Science 580 (2020): 30-48. https://doi.org/10.1016/j.jcis.2020.06.125
  • Jamróz, Ewelina, Piotr Kulawik, Pavel Kopel, Radka Balková, David Hynek, Zuzana Bytesnikova, Milica Gagic, Vedran Milosavljevic, and Vojtech Adam. „Intelligent and active composite films based on furcellaran: Structural characterization, antioxidant and antimicrobial activities.“ Food Packaging and Shelf Life 22 (2019): 100405. https://doi.org/10.1016/j.fpsl.2019.100405
  • Contreras‐Montoya, Rafael, Guillermo Escolano, Subhasish Roy, Modesto T. Lopez‐Lopez, Jose M. Delgado‐López, Juan M. Cuerva, Juan J. Díaz‐Mochón, Nurit Ashkenasy, José A. Gavira, and Luis Álvarez de Cienfuegos. „Catalytic and electron conducting carbon nanotube–reinforced lysozyme crystals.“ Advanced Functional Materials 29, no. 5 (2019): 1807351.  https://doi.org/10.1002/adfm.201807351
  • Contreras-Montoya, Rafael, María Arredondo-Amador, Guillermo Escolano-Casado, Mari C. Mañas-Torres, Mercedes González, Mayte Conejero-Muriel, Vaibhav Bhatia et al. „Insulin crystals grown in short-peptide supramolecular hydrogels show enhanced thermal stability and slower release profile.“ ACS Applied Materials & Interfaces 13, no. 10 (2021): 11672-11682. https://doi.org/10.1021/acsami.1c00639
  • Pavan, Cristina, Rosangela Santalucia, Guillermo Escolano-Casado, Piero Ugliengo, Lorenzo Mino, and Francesco Turci. „Physico-Chemical Approaches to Investigate Surface Hydroxyls as Determinants of Molecular Initiating Events in Oxide Particle Toxicity.“ International Journal of Molecular Sciences 24, no. 14 (2023): 11482. https://doi.org/10.3390/ijms241411482
  • Carella, Francesca, Lorenzo Degli Esposti, Davide Barreca, Gian Andrea Rizzi, Gianmario Martra, Pavlo Ivanchenko, Guillermo Escolano Casado et al. „Role of citrate in the formation of enamel-like calcium phosphate oriented nanorod arrays.“ CrystEngComm 21, no. 32 (2019): 4684-4689. DOI: 10.1039/C9CE00508K
  • Casado, Guillermo Escolano, Pavlo Ivanchenko, Geo Paul, Chiara Bisio, Leonardo Marchese, Amir M. Ashrafi, Vedran Milosavljevic, Lorenzo Degli Esposti, Michele Iafisco, and Lorenzo Mino. „Surface and structural characterization of Cu-exchanged hydroxyapatites and their application in H2O2 electrocatalytic reduction.“ Applied Surface Science 595 (2022): 153495. https://doi.org/10.1016/j.apsusc.2022.153495

Projektové oddělení

Naše projektové oddělení se zaměřuje na projektovou podporu vědeckých nápadů pracovníků z dílčích laboratoří našeho ústavu. V praxi aplikujeme znalosti, schopnosti, nástroje a technologie ke splnění požadavků projektových výzev na národní, mezinárodní a evropské úrovni.

Služby pro navrhovatele projektů

  • Hledání vhodných projektových výzev na základě žádosti řešitelů/aktuální nabídky grantových agentur,
  • Čtení a výtah důležitých informací ze zadávací dokumentace (komunikace s grantovými agenturami prostřednictvím Helpdesk),
  • Zajištění povinných příloh na úrovni univerzity, pomoc s ostatními dokumenty,
  • Pomoc a kontrola projektových bran,o pomoc s dílčími částmi projektu (obecného charakteru), tvorbou rozpočtu,
  • Odeslání projektu datovou schránkou,
  • Hledání vhodných projektových výzev proaktivně,
  • Pomoc s tvorbou konsorcií (hledání partnerů, síť kontaktů); nabídka komunikace s firmami

Podpora při realizaci projektů

  • Komunikace s ekonomickým, právním oddělením MENDELU,
  • Zajištění podpisů smluv, změn, čerpání (komunikace s Helpdesk),
  • Koordinace projektů na fakultě,
  • Pomoc s přípravou podkladů v případě ochrany duševního vlastnictví – před odesláním přes CTT MENDELU

Lidé a kontakty na Projektovém oddělení

Mgr. Dagmar Hegerová, Ph.D.
Vedoucí oddělení, projektová manažerka
Děkanát AF, budova C – přízemí
+420 545 133 009, +420 773 750 556
Evropské projekty, IGA AF
(zastupující u agendy mezinárodních projektů)
Ing. Anna Jánová, Ph.D.
Projektová manažerka – junior
Děkanát AF, budova C – přízemí
+420 545 133 009, +420 773 750 556
Mezinárodní projekty, mobilitní projekty pro výzkumníky a akademiky
(zastupující u agendy národních projektů)

Významná ocenění

  • doc. Mgr. Zbyněk Heger, PhD. – Cena děkana Agronomické fakulty za vynikající výsledky ve vědě, výzkumu a publikační činnosti
  • doc. Mgr. Zbyněk Heger, PhD. – Cena rektora Mendelovy univerzita v Brně za mimořádné výsledky tvůrčí činnosti mladých do 35 let, 2020
  • Kolektiv výzkumné skupiny molekulární biologie a nanomedicíny – Cena České urologické společnosti za nejlepší publikaci publikovanou v roce 2018, 2019
  • doc. Mgr. Zbyněk Heger, PhD. – Vědecká cena Ligy proti rakovině Praha, 2017
  • Kolektiv výzkumné skupiny molekulární biologie a nanomedicíny – Ocenění Purkyňovým nadačním fondem pro publikace s nejvyšším impakt faktorem za rok 2016, 2017
  • Ing. Lukáš Nejdl, Ph.D. – Ocenění rektora Mendelovy univerzity v Brně za udělení patentu s názvem „Způsob identifikace přírodních vzorků, zejména kapalných“
  • Bc. Jan Veselský – Talent roku Ostrava 2024 za bakalářskou práci „Mikrořasy jako biostimulátory a biomodulátory půdního mikrobiomu a jejich dopad na rostliny“
  • Ing. Kristýna Koláčková – Cena děkana za Vynikající studijní výsledky
  • Ing. Gabriela Dřínovská – Cena děkana za bakalářskou práci „Optimalizace stanovení vitaminu B12 pomocí mikrobiální metody pro sinici Arthrospira maxima“
  • Ing. Marek Straka – Mendelu Phd.D. Talent za projekt „Integration of methods for greener fate of phosphorus in wastewater“
  • Ing. Eliška Birgusová získala za práci s název ,,Elektrochemický biosenzor pro detekci metylace DNA“ zvláštní cenu poroty. Ocenění získala v celostátní soutěži o nejlepší studentskou vědeckou práci v oboru analytická chemie „O cenu Karla Štulíka 2021“
  • Ing. Eliška Birgusová získala za práci s názvem ,,Elektrochemická detekce jablečno-mléčné fermentace’’ zvláštní cena poroty, celostátní soutěži o nejlepší studentskou vědeckou práci v oboru analytická chemie „O cenu Karla Štulíka 2022“
  • Ing. Eliška Birgusová obdržela v roce 2023 talentové stipendium v rámci soutěže Mendelu P.hD. talent za projekt s názvem ,,Electrochemical detection and removal of estrogen from the water environment “
  • Ing. Eliška Birgusová, první místo konference MendelNet 2024 Molecular imprinting particles as a solution for estradiol water contamination
  • Ing. Zuzana Bytešníková, Ph.D, Cena rektora 2023 cena za mimořádné výsledky tvůrčí činnosti mladých do 35 let
  • RNDr. Stanislava Bezdíček Králová, PhD. Ocenění za nejlepší poster „“From Extreme Environments to Bioactive Discoveries: Unveiling the Potential of Antarctic Bacteria“, 5th European Conference on Natural Products, Německo (2024)
  • RNDr. Stanislava Bezdíček Králová, PhD. Ocenění Young Blood Award od týdeníku Euro, Česká republika (2023)
  • RNDr. Stanislava Bezdíček Králová, PhD.Cena kreativních hrdinů od Creative Heroes Award od Nizozemsko-české obchodní komory, Česká republika (2022)
  • RNDr. Stanislava Bezdíček Králová, PhD. Cena mladý český a slovenský mikrobiolog 2020, Česká republika
  • RNDr. Stanislava Bezdíček Králová, PhD. Cena děkana za publikaci vynikajících výsledků vlastního bádání, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Česká republika (2019)
  • doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D. Čestné uznání Ministra zdravotnictví za zdravotnický výzkum a vývoj pro rok 2019
  • doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D. Ocenění Pro ženy ve vědě 2018 společnosti L’Oréal-UNESCO, Česká Republika
  • doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D. Uznání rektora za reprezentaci VFU Brno v oblasti vědy a za mimořádné výsledky ve výzkumné činnosti v oblasti antibiotické rezistence (2018)
  • doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D. Cena rektora za rozvoj Veterinární univerzity Brno a výzkumný přínos k vzdělávání, vědě a výzkumu (2013)
  • doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D. Cena Předsedy Grantové agentury České republiky za rok 2013, projekt „Charakterizace koliformních bakterií rezistentních k cefalosporinům a hodnocení rizika použití antimikrobiálních látek na jejich selekci“
  • doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D. Cena společnosti pro lékařskou mikrobiologii za mimořádné publikační výstupy (2013)
  • Ing. Kristýna Šmerková, Ph.D. Čestné uznání za vynikající řešení individuálního projektu IGA AF MENDELU s názvem „Sledování PCR produktů moderními biofyzikálními metodami“ v rámci projektu „Excelence doktorského studia na AF MENDELU pro navazující evropskou vědecko-výzkumnou kariéru“ (2013)
  • Ing. Kristýna Šmerková, Ph.D. Ocenění na mezinárodní konferenci Mendelnet 2013 v sekci Aplikovaná chemie a biochemie za práci „Fluorescence properties of quantum dots“
  • Ing. Kristýna Šmerková, Ph.D.  Ocenění za nejlepší vědeckou publikaci s názvem s prací “Investigation of interaction between magnetic silica particles and lambda phage DNA fragment” v rámci projektu „Excelence doktorského studia na AF MENDELU pro navazující evropskou vědecko-výzkumnou kariéru” (2013)
  • Ing. Kristýna Šmerková, Ph.D. Ocenění za nejlepší poster „Optimization of DNA isolation using magnetic microparticles“, pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků (2012)
  • Ing. Kristýna Šmerková, Ph.D.  Ocenění na mezinárodní konferenci Mendelnet v sekci Aplikovaná chemie a biochemie za práci prací „Sledování interakce platinových léčiv s DNA pomocí Sangerova sekvenování“ (2012)
  • doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D. Cena děkana za významné výsledky doktorského studia, Fakulta veterinární hygieny a ekologie, Veterinární univerzita Brno (2010)
  • Ing. Katarína Molnárová Best oral presentation of the “The 4th International Conference on Waste Recycling and Management (ICWRM 2023)” with presentation “Negative Effect of Environment-Like Shaped PET-microparticles (1-5 µm) in Environment-Like Amount on Chlamydomonas reinhardtii and Chlorella vulgaris”. 17. – 19. 2. 2023, Singapore
  • Ing. Katarína Molnárová 2. Cenu na mezinárodní vědecké konferenci „MendelNet 2023“ získala v sekci „Plant Biology“ studentka Mgr. Katarína Molnárová za prezentaci příspěvku s názvem „Perchlorate-Tolerant Microalgae: Exploring Adaptation and Resource-Efficient Cultivation for Sustainable Martian Applications “
  • Ing. Katarína Molnárová 2. Cenu na mezinárodní vědecké konferenci „MendelNet 2022“ získala v sekci „Plant Biology“ studentka Mgr. Katarína Molnárová za prezentaci příspěvku s názvem „Marked by space: preparation, realisation and physiological results of microalgae in stratosphere “